アミノ酸とタンパク質は、ミネラルの世界から生物へと移行する中間体です。
それらの名称が示すように、アミノ酸は二官能性有機物質である。すなわち、それらはアミノ官能基(-NH 2)およびカルボキシル官能基(-COOH)からなる。 カルボキシル基に対してアミノ基が占める位置に応じて、それらはα、β、γなどであり得る。
αアミノ酸 | βアミノ酸 | γ-アミノ酸 |
生物学的に重要なアミノ酸はすべてα-アミノ酸です。
タンパク質構造は20個のアミノ酸からなる。
上記に示した一般構造から分かるように、アミノ酸はすべて共通部分とそれらを特徴付ける異なる部分(一般にRで表される)を有する 。
20個のアミノ酸のうち、19個が光学活性である(偏光面を逸脱する)。
ほとんどのアミノ酸はただ1つのアミノ基と1つのカルボキシルを持っているので、それらは中性アミノ酸と呼ばれます。 余分なカルボキシル基を持つものは酸性アミノ酸と呼ばれ、余分なアミノ基を持つものは塩基性アミノ酸です。
アミノ酸は結晶性の固体物質であり、そして水中で良好な溶解性を有する。
食事中のいくつかのアミノ酸の欠如は、発達における重大な変化を決定します。 実際には、人間の生物は正確に必須と呼ばれるいくつかのアミノ酸を合成することはできませんが(食事と一緒に導入する必要があります)、それだけでいくつかのアミノ酸(非必須アミノ酸)しか生成できません。
必須アミノ酸の欠如による疾患の1つは、kwashiorkor(翻訳されたアフリカの方言から派生した単語は「1番目と2番目」を意味する)として知られているものです。 最初の子供は正しいタンパク質摂取量を含む母親のミルクを見逃しているため、この病気は2人目の子供の出生後に、最初の子供に影響を与えます。 したがって、この病気は栄養不足の人々の間で広まり、下痢を引き起こします。これは食欲の欠如であり、生物の進行性の衰弱につながります。
すでに述べたように、グリシン(それはR基の代わりに水素を有するα−アミノ酸であり、そして風の最小のものである)を除いて、天然アミノ酸は、少なくとも1個の不斉炭素の存在により光学活性を有する。 天然アミノ酸では、アミノ基とカルボキシル基のみが属する不斉炭素の絶対配置はL系列に属します。
D-アミノ酸はタンパク質の構造に入ることはありません。
覚えている:
DNA ----転写→ m-RNA ----翻訳→ タンパク質
転写はL-アミノ酸としてコードすることができる。 D-アミノ酸は、非タンパク質構造に含まれることがあります(例えば、バクテリアの内壁:バクテリアには、D-アミノ酸を保護する役割を果たす遺伝情報はありませんが、酵素の遺伝情報はあります)。バクテリアコーティングの壁の面倒を見る)
アミノ酸に戻りましょう。R基の異なる構造は、各アミノ酸の個々の特性を定義し、タンパク質の特性に特定の貢献をします。
したがって、R基の性質に従ってアミノ酸を分割すると考えられていました。
極性だが荷電していないアミノ酸(7):
グリシン(R = H-)
セリナ(R = HO-CH 2 - )
スレオニン
トレオニンには2つの対称中心があります。自然界にはトレオニン2S、3Rのみが存在します。
トレオニンは必須アミノ酸です(必須と混同しないでください。すべてのアミノ酸が必須です)。それは、すでに述べたように、人間の細胞には遺伝的遺産がないため、それを含む食品を食べることです。このアミノ酸を生産することができます(この遺産は多くの植物とbetteriに存在します)。
セリンおよびスレオニンのヒドロキシル基はホスホリル基でエステル化することができる(ホスホセリンおよびホスホトレオニンを得る)。このプロセスはリン酸化と呼ばれる 。 リン酸化は、細胞の内側と外側との間のシグナルの翻訳のために本来使用されている。
システイン(R = HS-CH 2 - )
システインスルフヒドリルはセリンヒドロキシルよりも容易にプロトン化可能である:硫黄および酸素は両方とも第六の群からのものであるが、硫黄はそれが大きいのでより容易に酸化可能である。
チロシン[R = HO-(C 6 H 4)-CH 2 - ]
NB
(C 6 H 4)=二置換ベンゼン環
セリンおよびトレオニンに関しては、ヒドロキシルはエステル化(リン酸化)することができる。
アスパラギン(R = NH 2 −CO − CH 2 - )
グルタミン(R = NH 2 −CO − CH 2 −CH 2 - )
非極性アミノ酸(8)
疎水性側基を有する。 このクラスの中で私たちは区別します:
脂肪族 :
アラニン(R = CH 3 - )
バリン(R =(CH 3)2 -CH-)必須
ロイシン(R =(CH 3)2 -CH-CH 2 - )必須
イソロイシン(R =
メチオニン(R = CH 3 -S-CH 2 -CH 2 - )必須
細胞膜は、疎水性のためにタンパク質が固定された脂質二重層から構成されているため、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシンが含まれています。 メチオニンは、その一方で、ほとんど常に少量(約1%)で存在するアミノ酸です。
プロリン
芳香族 :
フェニルアラニン(R = Ph-CH 2 - )Ph =フェニル:必須一置換ベンゼン
トリプトファン(R =
芳香族であるこれら2つのアミノ酸は、近紫外線(約300 nm)の放射線を吸収します。 それ故、これらのアミノ酸を含有する既知のタンパク質の濃度を決定するためにUV分光光度法技術を利用することが可能である。
電荷を持つアミノ酸(5)
順番にそれらは区別されます:
酸性アミノ酸 (pH7で負電荷を有する極性残基を有する)は、それらが正電荷H +を生じさせることができるのでそのようなものである。
グルタミン酸(R =
これらのアミノ酸はそれぞれアスパラギンとグルタミンに由来する。 4つすべてが自然界に存在しています。つまり、それぞれに固有の情報があります。つまり、DNAにはそれぞれをコードする3つ組の塩基があります。
塩基性アミノ酸 (pH7で正電荷を有する極性残基を有する)は、それらが正電荷H +を受容することができるのでそのようなものである。
リジン(R =
アルギニン(R =
ヒスチジン(R =
側鎖にアミノ酸の誘導体が存在するタンパク質があります。例えば、ホスホセリンが存在する可能性があります(ホスホセリンをコードする遺伝情報はなく、セリンをコードする遺伝情報のみ)。 ホスホセリンは翻訳後修飾である:蛋白質合成が起こった後
DNA ----転写→ m-RNA ----翻訳→ タンパク質
そのような翻訳後修飾はタンパク質の側鎖に起こり得る。
また見なさい:蛋白質、化学の一見