潜在的な健康被害について最も議論されている染料の1つは青です。 特に、人工カラーのブルーパテントV （E 131）とブリリアントブルー （E 133）がドック上で数回上がっています。
これらの染料に代わる有効な天然代替品がないため、数年前、ネスレは市場から青いSmartiesを撤退することを余儀なくされました。
しかし最近では、学者たちはスピルリナ藻から有望な青い染料を単離することに成功しました。
その青い色合いは、光合成にクロロフィルと共に関与するタンパク質複合体であるフィコシアニンの一部であるいくつかの色素に依存します。 そのような色素は、クラマス藻類（ Aphanizomenon flos-aquae ）と同様に、スピルリナがその一部であるシアノバクテリア（藍藻類）に豊富にあります。
フィコシアニンからの青い染料はすでに業界でチューインガム、アイスクリーム、アイスキャンディー、お菓子、清涼飲料、乳製品そしてわさびに使われています。 商品名の1つは、日本の大日本インキ化学工業（DIC）によって開発された製品であるLina Blue®（Blue Spirulina）です。
他の天然青色染料は、特にブルーベリーおよび他の果実に豊富に存在するアントシアニンによって提供されている。
