現在、 アフリカ トリパノソーマ症に対する予防薬またはワクチンは入手できません。 予防対策は、したがって、これらのハエとの接触を最小限に抑えることを目的としています。
まず、感染地域は避けなければなりません。 ツェツェバエは一日の最も暑い時間には活動的ではありませんが、いらいらすると攻撃することができます。 この昆虫は動いている物や明るいあるいは暗い色に惹かれることを覚えておくべきです。 彼はまた薄い服で刺すことができます。 そのため、できるだけ手足を覆うシャツやズボンを着用することをお勧めします。 特に、環境に溶け込む耐性のある素材と中間色の服が好まれるべきです。 衣服への忌避剤の塗布もまた有用であり得る。 これらのハエの群れは動いている車を追うことができるので、車の窓を閉じて車内に侵入しないようにすることが望ましいです。
媒介昆虫との闘いは、繁殖のための生息地の破壊、tse-tseハエのための避難所での殺虫剤およびトラップの使用（パーメトリンを含浸させたほうがよい）を用いて環境レベルで実施できるそして水路沿いの植生と寄生虫の治療（保菌者の感染源）。
