また見なさい：膣の細菌叢、腸の細菌叢、口の細菌叢
一般性
ヒトの細菌叢は、皮膚などの露出領域にコロニーを形成する、または口腔、胃腸管、気道、膣および下部尿路などの外部と連絡する微生物種からなる。
出産時、新生児が母親の尿生殖路から来る微生物と接触すると、状況は急激に変化します。 その後の数時間と数日のうちに、人々が感染した細菌と、若い体が接触する環境が作り出されるでしょう。 この瞬間から、前述の身体領域は異なる微生物種からなるそれらの複雑な「生態系」を獲得し始めるでしょう。
一見したところ受動的なプロセスのように見えるかもしれませんが、実際には複雑で繊細なシステムであり、相互の利点からなる制約によって強く規制されています。 人体はそれ自身の細菌叢に栄養を与える基質を供給し、それが今度はそれを病原体から保護し、同じ生息地における他の微生物の発生を防ぎます。 これらの複雑な相互作用では、免疫システムは、バランスが崩れた場合に介入する準備ができている注意深い観客を表します。 通常有害ではない細菌は、制御なしに増殖したり、体の他の領域に移動したりすると、実際にそうなる可能性があります。
食料不足、外傷、長期にわたる抗生物質治療、または一時的な免疫防御の低下は、ヒトの微生物叢の変化を引き起こす可能性があります。
皮膚細菌叢
ご想像のとおり、体表面はさまざまな防御戦略（皮脂および脂質脂質膜に存在する脂質、水分補給不足、外部細胞層の頻繁な交換、酸性pHおよびその他の防御戦略）によって保護されています。汗の免疫グロブリン）。 このため、細菌の集落は、皮膚の開口部付近や腋窩や足の指状突起間のより湿気の多い部分に集中しています。 皮膚脂質および腺分泌物の分解は、ランダムに見て、上記の皮膚領域においてより強くなる悪臭の原因である。 同様に、通常の皮膚の細菌叢の変更は不快な匂いの原因となる可能性があり、これは必ずしも悪い個人衛生の指標ではありません。
皮脂の過剰な分泌、いくつかの微生物、特にPropionibacterium acnesの増殖によって支えられて、にきびやにきびの出現に伴って起こる炎症過程の開始を助長します。
呼吸器系の細菌叢
上気道の細菌叢は、口腔と非常によく似ていますが、量はそれほど多くありません。 呼吸木に沿って下降するにつれて、これらの微生物の濃度は、肺胞で消えるまでさらに減少します。
粘液性呼吸腺から分泌される粘液は、病原体から有機体を保護し、それらを内部に閉じ込め、それが備えている抗体を通してそれらを中和するのを助けます。
消化器系の細菌叢
消化管には印象的な数の微生物が定着しています。これらの微生物は定性的な観点からも特に多数あります。 口腔内に、細菌が発生する歯の表面に付着した一種の緑青、いわゆるバクテリアプラークがあります。 虫歯の主な原因はStreptococcus mutansとLactobacillus acidophilusです。 体は唾液を介したう蝕原性攻撃から身を守りますが、糖分が豊富すぎる食事に口腔衛生不良が伴う場合には、ほとんど不可能です。
この場合も、悪臭（口臭）はある種のバクテリアコロニーの存在の兆候である可能性があり、その代謝は不快な臭いを伴う揮発性の硫黄物質を生成する。
健康な人の口腔内には、Candida albicansのような病原体の小さなコロニーも見られます。 しかしながら、これらの微生物はそれらの病原性活性を実行するのに数値的に不十分な量で存在する。 体の防御力が一時的に低下するなどして病原性が高まると、特定の病理学的状態を引き起こすことがあります（ユリの特定の場合）。
胃では、微生物の存在は胃の酸性度によって強く制限されます。 例外は、長期的には潰瘍を形成させる可能性があるヘリコバクターピロリです。
