不活化ワクチンは完全なウイルスまたはバクテリア粒子の使用を含みますが、化学的に（例えばホルマリンまたはエチレンオキシドなどのキレート剤で）または物理的に（照射または熱で）処理され、複製能力を失います。または病気を引き起こす。
弱毒化ワクチンと比較して、それらは主な利点、安定性および安全性を有するが、それらは通常より低い免疫応答を誘導しそして免疫化を確実にするためにより多くの用量のワクチンが与えられるべきである。
このタイプの予防接種には、Salkの抗狂犬病ワクチンと抗ポリープワクチンが含まれます。
